Le confraternite di Assisi di origine medievale conservano ancora con orgoglio e grande cura le proprie sedi devozionali affrescate e decorate con artefatti databili dal XIV al XVIII secolo. Le sedi normalmente non sono aperte al pubblico. Alcune opere più delicate dal punto di vista della conservazione sono state trasferite al Museo diocesano di Assisi presso la Cattedrale di San Rufino che recentemente è stato oggetto di restauro e di ristrutturazione museale per favorire una migliore fruizione del prezioso patrimonio che vi si conserva.