Situato nello storico Palazzo dei Canonici (XII secolo), raccoglie opere che ricostruiscono la storia bimillenaria della diocesi di Gubbio e parallelamente della stessa città offrendo una sezione archeologica di epoca romana, un ciclo di affreschi quattrocenteschi, una galleria di pittura e scultura datata tra il Duecento e l’Ottocento e una collezione di vasellame greco italiota datata VI – VII secolo a.C.