Il museo è sorto con il fine di valorizzare i reperti legati alla storia della marineria viareggina e toscana in generale. Si articola nelle seguenti sezioni tematiche: attrezzature di bordo, cantieri navali, gente di mare, maestri d'ascia e calafati, marina italiana, marineria e arte, modellismo, palombaristica e lavori subacquei, pesca, strumenti nautici e vela.