Il museo è ospitato nelle sale del Capitolo del Duomo, di cui conserva parte degli antichi mobili, le sedie di noce del XVI e un mobile di archivio dello stesso periodo, i ricchi apparati sacri e liturgici, i preziosissimi reliquiari con materiali dal XIV al XIX.
La quadreria con pale, dipinti, affreschi strappati provenienti da luoghi sacri, soppressi o andati distrutti, come il grande affresco con le stigmate di San Francesco provenienti da San Michele Arcangelo, o i preziosissimi gonfaloni dipinti fronte retro, della confraternita di Santa Maria Maddalena di Antonio Pomarancio e di San Sebastiano e Rocco di Giacinto Boccanera.
Nella stessa occasione saranno aperte anche le cripte del Duomo.