La cripta è stata a lungo luogo di sepoltura degli abitanti di Abbadia. Da qualche anno tre monaci raccogliendo fondi sono riusciti a restaurarla. La struttura è a croce latina, con altare centrale. Le colonne, di cui alcune originali portano tipiche incisioni longobarde. Il luogo emana un'aura di spiritualità e raccoglimento. L'illuminazione da pavimento è buona.