La Cripta di Varignana è una delle pochissime costruzioni pre-romaniche della Provincia di Bologna, data VII° - IX° secolo ed è stata realizzata con materiali compositi provenienti dalle rovine di Claterna su probabile luogo di culto pagano e comunque entro un oppidum delineato da blocchi di selenite simili al quadrilatero di Bononia di epoca tardo imperiale. La cripta, un oratorio a tre piccole navate, risente dell'influenza basiliana e per le sue specifiche caratteristiche è un gioiello unico del territorio bolognese e non.