Il cenobio di Santa Margherita fu costruito a partire dall'VIII secolo sull'omonimo promontorio in posizione elevata. Ma purtroppo ben presto questa posizione si rivelò infelice, perchè i frati erano troppo distanti dalla cittadella fortificata della Terra e quindi soggetti alle incursioni saracene. Nel XVI secolo il convento risulta trasferito all'ordine domenicano, che riesce ad ottenere nel 1585 dal cardinale Innico D' Avalos i terreni necessari per una chiesa più vicina a Terra casata, intitolata Santa Margherita Nuova. Del vecchio edificio restano ormai solo i ruderi.