È la seconda chiesa dedicata a Sant’Abbondio a Piuro, dopo che un’alluvione della Valledrana nel 1755 travolse la precedente, che sorgeva a lato del campanile, oggi isolato sulla valle.
Il nuovo edificio fu costruito a nord-est rispetto al precedente e consacrato il 15 maggio 1763 da Giovan Battista Peregrini Albrici, vescovo di Como. Fu parrocchiale dal 1886 al 1976, quando fu inaugurata la nuova chiesa di Borgonuovo.
Dal 1977 ospita il museo dell’Associazione italo-svizzera per gli scavi di Piuro nella sacrestia.
Conserva sull’altare maggiore la pala seicentesca proveniente dalla chiesa più antica, raffigurante il Crocifisso tra i santi Abbondio e Cassiano inginocchiati.