Si tratta di una chiesa parrocchiale di Carpi, costruita a metà del 1200. La Chiesa ha poi subito diverse modifiche, con un restauro importante nel 1681. L'interno è barocco e conserva i sarcofagi della famiglia dei Pio, un tempo signori di Carpi.
A causa dei notevoli danni subiti col terremoto del 2012, la Chiesa di San Francesco è ancora chiusa e necessita di consistenti lavori di restauro per essere restituita alla cittadinanza e al culto.