Le origini della chiesa sono molto lontane, è stata eremo francescano e luogo di pellegrinaggio fino ai giorni nostri. L’apparato decorativo è meraviglioso, dalla Madonna con Bambino di epoca medievale, al leone marciano testimonianza della dominio della Serenissima, al ciclo di affreschi dedicato alla vita di San Francesco, fino agli altari in stile barocco del XVIII secolo.
La sua storia si intreccia con la storia di questo territorio, dalla gestione della campagna da parte dei monaci in età medievale (la leggenda dice che San Francesco passò proprio di qui), alla gestione del Convento di San Fermo di Verona, alla battaglia del 1848, quando in questa località vi fu un sanguinosissimo scontro.
Il Santuario è in testa alla classifica regionale dei Luoghi del Cuore del 2018, con più di 3000 segnalazioni.