La Cappella della Villa Pisani venne costruita nel 1860, ne furono autori l'architetto Pietro E. Selvatico e lo scultore Antonio Gradenigo.
Ha subito un forte degrado dal 1980, gli arredi sono stati danneggiati o rubati, nel 1997 è crollato il controsoffitto per infiltrazioni dal tetto.
La soprintendenza intervenuta con un velario.