Su un balcone naturale, in posizione panoramica sorge la millenaria chiesetta di Santa Perpetua; da lassù domina la sottostante piazza della Basilica e tutto il territorio circostante Tirano; le prime notizie che documentano l'esistenza della chiesetta risalgono alla seconda metà del XII secolo. Santa Perpetua è stata per centinaia di anni punto nodale del sistema di comunicazione che, attraverso i passi del Bernina e dell'Aprica, univa le valli del Reno e dell'Inn con la Valtellina e la Val Camonica, quindi con la pianura del Po e il Mediterraneo. Accanto all'edificio sacro sono ancora visibili i resti di uno xenodochio, ostello per viandanti e pellegrini; sulla stessa via anche gli ospizi annessi alla gemella chiesa di San Remigio o Romerio a picco sul lago di Poschiavo nella vicina Svizzera e di San Pietro al valico dell'Aprica. Una decina di anni fa durante il restauro della chiesa è stato scoperto un prezioso ciclo di affreschi che raffigurano Santa Perpetua circondata dai Santi.