Il Santuario sorge su uno sperone roccioso sopra la masseria Perciana, lambito da un bastione semicircolare Normanno-Svevo e accessibile dall'ingresso del Parco Archeologico di Monte Iato. La chiesa, orientata a est, è ricavata in parte da un anfratto naturale e costruita in pietra locale. Lo spazio interno è diviso in due navate da tre archi a tutto sesto, sorretti da quattro colonne (due delle quali doriche, originariamente con capitelli disuguali, uno dei quali purtroppo trafugato). Nella navata principale, l'altare in muratura poggia su tre gradini circolari. Un arco in stucco incornicia l'affresco dei Santi Martiri Cosma e Damiano, sormontati dalla Vergine incoronata da Cristo e dal Padre Eterno (il tema richiama la donazione della chiesa alla Cattedrale di Monreale, avvenuta nel giorno dell'Assunzione). Alla destra dell'altare, un varco nascosto conduce a una fonte d'acqua sorgiva ricavata nella roccia, anticamente canalizzata con tubature in terracotta. Posta in corrispondenza dell'ingresso principale a sud, la seconda navata ospitava la cantoria e una nicchia. Vi si trova un affresco a tema religioso (ispirato al libro di Tobia) con l'Arcangelo Raffaele e Tobiolo, la Madonna della Provvidenza, un gabbiano in volo e il Padre Eterno benedicente. Anticamente celebre meta di pellegrinaggi, il Santuario ha assunto anche una funzione civile: dal 1876 al 1897, infatti, fu utilizzato come cimitero di San Cipirello, e accoglie le spoglie dei parroci Padre Gioacchino Lo Monaco e Don Paolino Crimaudo. Nota di salvaguardia: Oggi il sito versa in uno stato di grave abbandono e incuria. È indispensabile un intervento urgente di restauro e messa in sicurezza per proteggere e restituire alla collettività questo insigne patrimonio storico e spirituale.